По окончании университета некоторое время Марина была стажером адвоката в районной юридической консультации в Виннице. В конце 1990-х годов Ставнийчук работала в Институте государства и права.

В 1999 году она стала одним из членов Центральной избирательной комиссии. Некоторое время была заместителем главы ЦИК. Летом 2007 года президент Ющенко сделал Ставнийчук заместителем руководителя своего Секретариата. Также на протяжении трех лет Марина представляла главу государства в Конституционном суде и ЦИК. 

В апреле 2011 года Янукович вернул Ставнийчук на должность замглавы президентского Секретариата. Но уже через несколько дней она попала под сокращение штатов в связи с проведением административной реформы. 

Однако президент сделал ее своим советником и руководителем Главного управления по вопросам конституционно-правовой модернизации президентской администрации. На этой должности Марина оставалась до осени 2014 года и была уволена президентом Порошенко.

С 2009 по 2013 год Ставнийчук входила в состав Европейской комиссии за демократию через право (Венецианской комиссии). В октябре 2016 года она зарегистрировалась в качестве физического лица-предпринимателя (деятельность в сфере права). В конце 2017 года Марина возглавила комитет по вопросам верховенства права Национальной ассоциации адвокатов Украины.

Ставнийчук — автор более полусотни научных работ об украинском парламентаризме, по избирательному и конституционному праву. Марина имеет первый ранг государственного служащего.

Ставнийчук возглавляет общественные организации «За демократию через право» и «Развитие Украины будущего».